熊杰,男,毕业于中国科学院水生生物研究所,博士学位,现任中国科学院水生生物研究所副研究员

研究方向为原生动物基因组学。

中文名

熊杰

毕业院校

中国科学院水生生物研究所

学位/学历

博士

职业

科研工作者

职务

中国科学院水生生物研究所副研究员

教育背景

2003年9月-2007年6月,南京农业大学,水产养殖学,农学学士;

2007年9月-2011年11月,中国科学院水生生物研究所,水生生物学,理学博士;

工作经历

2012年1月-2015年12月,中国科学院水生生物研究所,助理研究员;

2014年8月-2015年8月,美国密歇根大学,博士后;

2015年12月至今,中国科学院水生生物研究所,副研究员;

科研成就

科研项目

(1)三种四膜虫全基因组n6-甲基腺嘌呤的鉴定及其功能进化,主持,国家级,2017-01--2020-12

(2)中国科学院青年创新促进会会员人才专项,主持,部委级,2016-01--2019-12

(3)中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目,主持,市地级,2014-01--2015-12

(4)模式生物嗜热四膜虫转录组数据库建设,主持,院级,2014-01--2015-12

(5)模式原生动物嗜热四膜虫dna复制起点的鉴定及其特征分析,主持,国家级,2014-01--2016-12

(6)原生动物四膜虫生殖小核(germlinenucleus)体功能(somaticfunction)的分子基础研究,主持,国家级,2019-01--2021-12

论文著作

(1) single-cell transcriptome sequencing of rumen ciliates provides insight into their molecular adaptations to the anaerobic and carbohydrate-rich rumen microenvironment, molecular phylogenetics and evolution, 2020, 第 7 作者

(2) sexual cell cycle initiation is regulated by cdk19 and cyc9 in tetrahymena thermophila, journal of cell science, 2020, 第 5 作者

(3) proteomic identification and expression of oral apparatus constituents in cell regeneration of giant ciliate stentor coeruleus (strain whel), gene, 2020, 第 5 作者

(4) tetrahymena comparative genomics database (tcgd): a community resource for tetrahymena, database, 2019, 第 8 作者

(5) insights into the origin and evolution of peritrichia (oligohymenophorea, ciliophora) based on analyses of morphology and phylogenomics, molecular phylogenetics and evolution, 2019, 第 3 作者

(6) rnai-dependent polycomb repression controls transposable elements in tetrahymena, genes & development, 2019, 第 2 作者

(7) hidden genomic evolution in a morphospecies—the landscape of rapidly evolving genes in tetrahymena, plos biology, 2019, 第 1 作者

(8) exploration of genetic variations through single‐cell whole‐genome sequencing in the model ciliate tetrahymena thermophila, journal of eukaryotic microbiology, 2019, 第 3 作者

(9) 进展中的原生动物学研究:热点领域与新格局, progress of protozoological studies in china: hot spots and new patterns, 中国科学:生命科学, 2019, 第 1 作者

(10) xploration of genetic variations through single‐cell whole‐genome sequencing in the model ciliate tetrahymena thermophila, journal of eukaryotic microbiology, 2019, 第 3 作者

(11) eogd: the euplotes octocarinatus genome database, bmc genomics, 2018, 第 4 作者

(12) a dp-like transcription factor protein interacts with e2fl1 to regulate meiosis in tetrahymena thermophila, cell cycle, 2018, 第 5 作者

(13) pseudocohnilembus persalinus genome database-the first genome database of facultative scuticociliatosis pathogens, bmc genomics, 2018, 第 5 作者

(14) a germline-limited piggybac transposase gene is required for precise excision in tetrahymena genome rearrangement, nucleic acids research, 2017, 第 4 作者

(15) dissecting relative contributions of cis-and trans-determinants to nucleosome distribution by comparing tetrahymena macronuclear and micronuclear chromatin, nucleic acids research, 2016, 第 1 作者

(16) epidermal growth factor-induced stimulation of proliferation and gene expression changes in the hypotrichous ciliate, stylonychia lemnae, gene, 2016, 通讯作者

(17) 四膜虫功能基因组数据库增量更新 2016-生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设, 基因组学与应用生物学, 2016, 通讯作者

(18) tracing the structural evolution of eukaryotic atp binding cassette transporter superfamily, scientific reports, 2015, 第 1 作者

(19) genome of the facultative scuticociliatosis pathogen pseudocohnilembus persalinus provides insight into its virulence through horizontal gene transfer, scientific reports, 2015, 第 1 作者

(20) the genome of the myxosporean thelohanellus kitauei shows adaptations to nutrient acquisition within its fish host, genome biology and evolution, 2014, 第 2 作者

(21) impaired replication elongation in tetrahymena mutants deficient in histone h3 lys 27 monomethylation, genes & development, 2013, 第 2 作者

(22) tetrahymena functional genomics database (tetrafgd): an integrated resource for tetrahymena functional genomics, database, 2013, 第 1 作者

(23) transcriptome analysis of the model protozoan, tetrahymena thermophila, using deep rna sequencing, plos one, 2012, 第 1 作者

(24) tetrahymena gene expression database (tged): a resource of microarray data and co-expression analyses for tetrahymena, science china life sciences, 2011, 第 1 作者

(25) gene network landscape of the ciliate tetrahymena thermophila, plos one, 2011, 第 1 作者

(26) genome-wide identification and evolution of atp-binding cassette transporters in the ciliate tetrahymena thermophila: a case of functional divergence in a multigene family, bmc evolutionary biology, 2010, 第 1 作者

人才培养

现指导硕士研究生1人

荣誉表彰

中国动物学会原生动物学分会青年科技奖,其他,2017

青年科技奖,一等奖,研究所(学校),2016

湖北省优秀博士论文奖,一等奖,省级,2013

中国科学院青年创新促进会会员